Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EFNA1P20827 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms