Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG2P13727 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms