Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPP2O95045 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPP2O95045 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPP2O95045 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPP2O95045 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPP2O95045 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP2O95045 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms