Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms