Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP5LA4QPB2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms