Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC162PA2VCL2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms