Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A8Q9Y2E8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms