Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALD1Q9ULE6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALD1Q9ULE6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms