Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNRD1Q9P1U0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms