Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELLSQ9NRZ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms