Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP2

MLXIP, MLX-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLXIPQ9HAP2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MLXIPQ9HAP2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms