Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms