Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGMATQ9BSE5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms