Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPAS2Q99743 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPAS2Q99743 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms