Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC1Q96C34 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms