Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDZRN4Q6ZMN7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms