Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms