Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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