Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTC4SQ16873 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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