Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H2Q13888 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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