Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms