Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms