Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA2P47869 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms