Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJC1P36383 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJC1P36383 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJC1P36383 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms