Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGFR1P11362 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR1P11362 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms