Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

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Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
AGRNO00468 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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