Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHDC2Q9Y2U9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHDC2Q9Y2U9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms