Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS1Q9NYS0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS1Q9NYS0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms