Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH6AQ9H0K4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH6AQ9H0K4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms