Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRIPQ8WXE1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRIPQ8WXE1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms