Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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