Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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