Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN5Q08AF3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN5Q08AF3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms