Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4DQ08499 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4DQ08499 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms