Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPNP63162 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms