Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UFM1P61960 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms