Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9AP51151 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms