Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GJC1P36383 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GJC1P36383 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GJC1P36383 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GJC1P36383 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJC1P36383 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms