Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CASQ1P31415 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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