Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMBRP28336 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMBRP28336 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMBRP28336 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMBRP28336 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMBRP28336 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms