Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms