Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTSS1O43312 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTSS1O43312 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms