Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRN3E7EW58 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRN3E7EW58 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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