Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM233B4DJY2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms