Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNAL1Q9UBT7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms