Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC17Q9NP64 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms