Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRMS1Q9HCU9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms