Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms