Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms