Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms